Allora l'ISO file non è un file video, è un file immagine, pensalo come una foto, uguale. Tu puoi fare un file ISO di una qualsiasi cosa. Poi è la tecnologia degli HDD multimediali che ha fatto sua questa estensione facilitando così la navigazione dei file DVD che sarebbero 4 tracce VOB. Se i vob hanno l'audio digitale lui ti porta il digitale, se ha il mono lui ti porta il mono. Non dipende quindi dall'ISO, ma dalla fonte. Con le ISO per esempio tu puoi fare i back up del tuo HDD e così via. Spero di essermi spiegato meglio.
Avere un case multimediale con HDD è sempre meglio anche se opzionale. Con un HDD all'interno l'accesso è immediato, di più facile consultazione. E' una opzione quindi, ma sempre consigliato considerando poi quanto costano gli HDD adesso.
Case multimediali con lettore DVD ne ho avuti, sono molto costosi e non ne vedo il senso. Una volta che puoi fare l'ISO avere anche il lettore lo trovo inutile. Un case multimediale con lettore bluray invece, almeno per il momento IO non ne ho mai visti.
Il file MKV è generalmente un file compresso da supporto bluray. Anche se di ottima qulità non è la stessa cosa di avere un file non compresso. Personalmente non ho mai rippato un file da bluray, mi hanno solo detto che un po' ci vuole.
Se tu vuoi il massimo risultato devi per forza adeguarti comprano un lettore bluray, una TV full HD (che mi hai detto che hai già) e collezionare i dischi bluray, non c'è altra soluzione.